Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Slc27a2O35488 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slc27a2O35488 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Slc27a2O35488 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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Slc27a2O35488 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Slc27a2O35488 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Slc27a2O35488 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Slc27a2O35488 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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