Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TnxbO35452 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms