Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Polr1aO35134 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1aO35134 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms