Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ArxO35085 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Nrf1-206ENSMUST00000115204 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ArxO35085 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ArxO35085 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ArxO35085 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ArxO35085 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms