Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
EllO08856 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
EllO08856 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
EllO08856 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
EllO08856 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
EllO08856 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
EllO08856 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
EllO08856 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
EllO08856 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
EllO08856 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
EllO08856 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms