Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Eftud2O08810 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Eftud2O08810 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms