Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
MttpO08601 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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MttpO08601 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MttpO08601 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MttpO08601 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MttpO08601 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MttpO08601 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MttpO08601 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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MttpO08601 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
MttpO08601 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MttpO08601 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MttpO08601 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MttpO08601 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MttpO08601 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MttpO08601 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MttpO08601 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MttpO08601 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MttpO08601 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
MttpO08601 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
MttpO08601 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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MttpO08601 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
MttpO08601 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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