Protein–RNA interactions for Protein: O08583

Alyref, THO complex subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlyrefO08583 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
AlyrefO08583 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
AlyrefO08583 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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