Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3278L7N2D2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms