Protein–RNA interactions for Protein: L7N219

Gm5458, Predicted gene 5458, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5458L7N219 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm5458L7N219 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm5458L7N219 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm5458L7N219 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
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Gm5458L7N219 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm5458L7N219 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm5458L7N219 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm5458L7N219 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm5458L7N219 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
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Gm5458L7N219 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Gm5458L7N219 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
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