Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm5294J3QP53 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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