Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Gm20795J3QP49 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms