Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc180J3QNE4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Ccdc180J3QNE4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms