Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
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Gm20918J3QN17 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Gm20918J3QN17 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20918J3QN17 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20918J3QN17 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20918J3QN17 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20918J3QN17 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
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Gm20918J3QN17 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm20918J3QN17 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
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