Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Cldn34c3J3QJW5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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