Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21411J3KMS0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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