Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sclt1G5E861 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sclt1G5E861 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sclt1G5E861 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sclt1G5E861 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sclt1G5E861 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sclt1G5E861 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sclt1G5E861 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Sclt1G5E861 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sclt1G5E861 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms