Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Nccrp1G3X9C2 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nccrp1G3X9C2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms