Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp9yF8VPU6 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms