Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm43037-201ENSMUST00000196808 250 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Farp1F8VPU2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms