Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm5160F8VPN3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms