Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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H2-M1F7CXU4 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
H2-M1F7CXU4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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H2-M1F7CXU4 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
H2-M1F7CXU4 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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