Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm5861F6VCN9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Gm5861F6VCN9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gm5861F6VCN9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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