Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Krt78E9Q0F0 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Krt78E9Q0F0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms