Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fndc1E9Q043 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Fndc1E9Q043 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms