Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
4931408C20RikE9PWP9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms