Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm3002E9PW72 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms