Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttc17E9PVB5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttc17E9PVB5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms