Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccdc175E9PVB3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms