Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syde2E9PUP1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms