Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Soga1E1U8D0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms