Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim12cD3Z3L3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Trim12cD3Z3L3 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms