Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tpm3-rs7D3Z2H9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms