Protein–RNA interactions for Protein: D3YX71

Gm8973, Predicted gene 8973, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8973D3YX71 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm8973D3YX71 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm8973D3YX71 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm8973D3YX71 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm8973D3YX71 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gm8973D3YX71 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm8973D3YX71 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms