Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Abcc8B2RUS7 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Abcc8B2RUS7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms