Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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PtprbB2RU80 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PtprbB2RU80 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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