Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Zscan5bB2RTN3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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