Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrn3B2RS91 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rrn3B2RS91 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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