Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Znf518bB2RRE4 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Znf518bB2RRE4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Znf518bB2RRE4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Znf518bB2RRE4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Znf518bB2RRE4 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Znf518bB2RRE4 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Znf518bB2RRE4 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms