Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Brpf1B2RRD7 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Brpf1B2RRD7 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms