Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Tmem238A9JSM3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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