Protein–RNA interactions for Protein: A7L9Z8

Atp2c2, Calcium-transporting ATPase type 2C member 2, mousemouse

Predictions only

Length 944 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2c2A7L9Z8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp2c2A7L9Z8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms