Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Prr16A3KMN5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms