Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Odf2A3KGV1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms