Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
H2al1jA2BFR3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
H2al1jA2BFR3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
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