Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Samt1A2BED8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Samt1A2BED8 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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