Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Patl2A2ARM1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Patl2A2ARM1 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms