Protein–RNA interactions for Protein: A2APX8

Scn1a, Sodium channel protein type 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn1aA2APX8 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Scn1aA2APX8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Scn1aA2APX8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Scn1aA2APX8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Scn1aA2APX8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Scn1aA2APX8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms