Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lcn6A2AJB9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Lcn6A2AJB9 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lcn6A2AJB9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lcn6A2AJB9 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Lcn6A2AJB9 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Lcn6A2AJB9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms