Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Calcoco2A2A6M5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms